公益財団法人どうぶつ基金の活動資金は、その90%以上が個人の方を中心とした民間からの寄付となります。国や地方自治体からの補助金・助成金は一切受けておりません。活動資金の独立性を保つことで、いかなる方面からも干渉や影響を受けない、公平・公正で自由な活動が可能になります。
2024年度
収入の内訳

総収入:364,126,192円
- 民間からの寄付:323,677,881円
- チャリティグッズ販売:5,507,750円
- その他:34,940,561円
支出の内訳

総支出:375,012,759円
- 不妊手術助成費用:291,400,794円
- 里親さがし助成金:7,671,584円
- 広報活動費:19,191,616円
- 事業管理費:55,907,812円
- 一般管理費:840,953円